El traslado de San Nicolás a Bari tuvo una gran repercusión en Rusia, como lo demuestran numerosos manuscritos contemporáneos, y el hecho de que la fiesta dedicada a ella ya se certifique en un mesjaceslov (calendario de las fiestas de los santos) de 1144. Peregrinaciones de Rusia a Bari comenzaron al menos a partir de la segunda mitad del siglo XV, se intensificaron especialmente a partir de finales del siglo XVII.
Hoy en día, la basílica románica es probablemente el único santuario católico visitado por peregrinos ortodoxos que, en la cripta, en la tumba, tienen su propio altar para actuar como oficios. La peregrinación rusa ortodoxa, que inicialmente era de media camada, se hizo cada vez más frecuente hasta que se convirtió en misa después de 2000.
La presencia en la Basílica de la peregrinación ortodoxa se ha vuelto tan considerable que los dominicanos han decidido hacer un gesto de apertura al entregar la Iglesia de San Nicolás a los peregrinos ortodoxos el 22 de mayo y el 19 de diciembre, aprovechando el hecho de que, según el calendario juliano, las fechas corresponden a las solemnidades nicolaianas del 9 de mayo y 6 de diciembre.
Una elección en profunda armonía con el gesto ecuménico realizado por el Papa Juan Pablo II que, en febrero de 1984, encendió la lámpara uniflamma vertiendo el aceite junto con el metropolitano ortodoxo de Myra Chrysostomos Konstantinidis. La lámpara, colocada junto al tabernáculo, tiene la forma de una carabela e indica la única fe católica y ortodoxa, alimentada por dos tradiciones, la oriental y la occidental. La iluminación de la lámpara unillama se realizará junto con la veneración de las reliquias de San Nicolás, uno de los momentos más significativos de la visita del Papa Francisco a la Basílica de Bari el 7 de julio de 2018.